MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017782	AAG	2	6	7	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
2	NC_017782	GAT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
3	NC_017782	TC	3	6	36	41	0 %	50 %	0 %	50 %	386858668
4	NC_017782	ACA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858668
5	NC_017782	AAATAA	2	12	68	79	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858668
6	NC_017782	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
7	NC_017782	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
8	NC_017782	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
9	NC_017782	AGA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
10	NC_017782	AGA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
11	NC_017782	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
12	NC_017782	GA	3	6	256	261	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
13	NC_017782	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
14	NC_017782	AG	3	6	288	293	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
15	NC_017782	ATA	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
16	NC_017782	AAG	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
17	NC_017782	GAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
18	NC_017782	A	6	6	462	467	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
19	NC_017782	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
20	NC_017782	TAT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
21	NC_017782	TAG	2	6	542	547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
22	NC_017782	GA	3	6	552	557	50 %	0 %	50 %	0 %	386858668
23	NC_017782	A	6	6	581	586	100 %	0 %	0 %	0 %	386858668
24	NC_017782	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858668
25	NC_017782	GT	3	6	614	619	0 %	50 %	50 %	0 %	386858669
26	NC_017782	A	9	9	635	643	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
27	NC_017782	ATA	2	6	695	700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
28	NC_017782	AT	3	6	709	714	50 %	50 %	0 %	0 %	386858669
29	NC_017782	TAA	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
30	NC_017782	T	6	6	775	780	0 %	100 %	0 %	0 %	386858669
31	NC_017782	A	7	7	808	814	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
32	NC_017782	AGA	2	6	843	848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858669
33	NC_017782	T	6	6	866	871	0 %	100 %	0 %	0 %	386858669
34	NC_017782	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
35	NC_017782	TAT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
36	NC_017782	AATTTA	2	12	965	976	50 %	50 %	0 %	0 %	386858669
37	NC_017782	A	6	6	976	981	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
38	NC_017782	GT	3	6	986	991	0 %	50 %	50 %	0 %	386858669
39	NC_017782	A	6	6	1024	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
40	NC_017782	A	7	7	1031	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
41	NC_017782	TAA	3	9	1070	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
42	NC_017782	A	6	6	1087	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
43	NC_017782	GAAA	2	8	1109	1116	75 %	0 %	25 %	0 %	386858669
44	NC_017782	TTA	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
45	NC_017782	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858669
46	NC_017782	A	7	7	1151	1157	100 %	0 %	0 %	0 %	386858669
47	NC_017782	AAT	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
48	NC_017782	AGG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858670
49	NC_017782	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
50	NC_017782	TCT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858670
51	NC_017782	TTATT	2	10	1292	1301	20 %	80 %	0 %	0 %	386858670
52	NC_017782	TGT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
53	NC_017782	AT	4	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
54	NC_017782	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
55	NC_017782	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	386858670
56	NC_017782	TAATAT	2	12	1364	1375	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
57	NC_017782	CAGG	2	8	1397	1404	25 %	0 %	50 %	25 %	386858670
58	NC_017782	TTTA	2	8	1460	1467	25 %	75 %	0 %	0 %	386858670
59	NC_017782	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
60	NC_017782	ATTAT	2	10	1516	1525	40 %	60 %	0 %	0 %	386858670
61	NC_017782	GTT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
62	NC_017782	AGT	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858670
63	NC_017782	ATT	2	6	1634	1639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
64	NC_017782	TA	3	6	1676	1681	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
65	NC_017782	TTG	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
66	NC_017782	T	6	6	1754	1759	0 %	100 %	0 %	0 %	386858670
67	NC_017782	TAGC	2	8	1798	1805	25 %	25 %	25 %	25 %	386858670
68	NC_017782	TAA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
69	NC_017782	TA	3	6	1833	1838	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
70	NC_017782	AT	3	6	1852	1857	50 %	50 %	0 %	0 %	386858670
71	NC_017782	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
72	NC_017782	AG	3	6	1871	1876	50 %	0 %	50 %	0 %	386858670
73	NC_017782	AT	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017782	AGG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017782	AT	3	6	1988	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
76	NC_017782	A	6	6	2030	2035	100 %	0 %	0 %	0 %	386858671
77	NC_017782	TTA	2	6	2092	2097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
78	NC_017782	GATG	2	8	2101	2108	25 %	25 %	50 %	0 %	386858671
79	NC_017782	AT	3	6	2162	2167	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
80	NC_017782	ATT	2	6	2169	2174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
81	NC_017782	TTG	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858671
82	NC_017782	GAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858671
83	NC_017782	A	6	6	2444	2449	100 %	0 %	0 %	0 %	386858671
84	NC_017782	TAAT	2	8	2459	2466	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
85	NC_017782	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858672
86	NC_017782	A	6	6	2535	2540	100 %	0 %	0 %	0 %	386858672
87	NC_017782	ATTTT	2	10	2563	2572	20 %	80 %	0 %	0 %	386858672
88	NC_017782	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858672
89	NC_017782	TAT	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
90	NC_017782	TAT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
91	NC_017782	ATTTT	2	10	2668	2677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017782	TAT	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017782	ACT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017782	TAG	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017782	TTC	2	6	2708	2713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017782	TAC	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017782	AGAA	2	8	2773	2780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017782	TAT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017782	T	7	7	2831	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017782	AT	3	6	2874	2879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017782	T	7	7	2906	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017782	AT	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017782	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017782	ATA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
105	NC_017782	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
106	NC_017782	TAA	3	9	2989	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
107	NC_017782	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
108	NC_017782	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	386858673
109	NC_017782	TAAA	2	8	3072	3079	75 %	25 %	0 %	0 %	386858673
110	NC_017782	TTA	2	6	3144	3149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858673
111	NC_017782	TGT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858673
112	NC_017782	ACA	3	9	3227	3235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
113	NC_017782	CATT	2	8	3263	3270	25 %	50 %	0 %	25 %	386858673
114	NC_017782	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858673
115	NC_017782	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
116	NC_017782	CAAT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	0 %	25 %	386858673
117	NC_017782	TATTTA	2	12	3578	3589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017782	TAT	2	6	3593	3598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017782	TTTGTT	2	12	3606	3617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017782	T	6	6	3616	3621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017782	TGTCTT	2	12	3643	3654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017782	ATG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017782	ATA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017782	TAC	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017782	N	712	712	3742	4453	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017782	T	6	6	4484	4489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017782	ATA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017782	TCTT	2	8	4546	4553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017782	TCTT	2	8	4557	4564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017782	TAT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017782	ATGA	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	386858674
132	NC_017782	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858674
133	NC_017782	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858674
134	NC_017782	CAAT	2	8	4827	4834	50 %	25 %	0 %	25 %	386858674
135	NC_017782	TA	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	386858674
136	NC_017782	TTCT	2	8	4931	4938	0 %	75 %	0 %	25 %	386858674
137	NC_017782	AAAT	2	8	4966	4973	75 %	25 %	0 %	0 %	386858674
138	NC_017782	T	8	8	4992	4999	0 %	100 %	0 %	0 %	386858674
139	NC_017782	TTCTT	2	10	5014	5023	0 %	80 %	0 %	20 %	386858674
140	NC_017782	TCT	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017782	T	7	7	5077	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017782	TCT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017782	T	8	8	5118	5125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017782	TCT	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_017782	TAT	2	6	11255	11260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017782	AAAG	2	8	11273	11280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017782	ATA	2	6	11281	11286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017782	A	7	7	11291	11297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017782	TTAC	2	8	11311	11318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
286	NC_017782	GTT	2	6	11332	11337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017782	CAT	2	6	11360	11365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017782	AT	3	6	11380	11385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017782	ATTT	2	8	11415	11422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017782	AACA	2	8	11474	11481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
291	NC_017782	ATTC	2	8	11499	11506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_017782	T	6	6	11546	11551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017782	GT	3	6	11552	11557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017782	TTA	2	6	11564	11569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.